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Les entérobactéries productrices de carbapénémase (EPC) sont des bactéries multirésistantes aux antibiotiques qui se propagent dans les hôpitaux du monde entier. La colonisation intestinale par EPC implique un déséquilibre du microbiote intestinal (dysbiose), qui pourrait altérer la réponse immunitaire de l'hôte.

Dans un article publié dans la revue Nature Communications (https://www.nature.com/articles/s41467-022-35767-4), l'équipe OpinfIELD a analysé les liens entre la colonisation intestinale par EPC et la réponse à une infection pulmonaire à Pseudomonas aeruginosa. La colonisation intestinale par EPC était associée à une infection pulmonaire par P. aeruginosa plus sévère par le biais d'une réponse immunitaire cellulaire altérée. Cette altération est la conséquence de la dysbiose digestive associée à la colonisation par EPC. En effet, cette dysbiose se caractérise par une quasi-disparition de certaines bactéries commensales et des concentrations plus faibles en acides gras à chaîne courte, connus pour être de puissants immunomodulateurs. La transplantation de microbiote fécal améliorait le pronostic de l'infection pulmonaire. Ces résultats remettent en question la notion de portage "asymptomatique" d’EPC, associé dans ce modèle à une dysbiose intestinale ayant un impact sur la réponse de l'hôte à une infection.